基础医学教育是医学教育的基石和核心，基础医学自1981年招收硕士研究生，2011年批准为一级学科硕士学位授权点, 2017年被批准为山东省博士学位授予立项建设单位骨干学科，根据学科发展水平数据监测平台2021年06月软科和学科热度排名，本学科为主流、热门学科，全国排名第44位，所在百分位段40%。ESI排名生物与生物化学、免疫学已进入前1%。已经建成较为齐全的基础医学学科方向，现有5个主要研究方向：病原生物学、免疫学、病理学与病理生理学、法医学、人体解剖与组织胚胎学。