龙年首篇!我院本科生在中科院一区杂志发表研究性论文
日期: 2024-02-26   来源: 临床与基础医学院(所)   浏览量:

近期,我院(所)本科生在国际期刊Cancer Letters (中科院1区,IF=9.756)发表题为 “Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma”的研究性论文。生物化学与分子生物学系指导老师郭殿豪、2020级临床医学本科生盛楷雯和张琦为共同第一作者,附属肿瘤医院于金明院士及团队成员张竞泽、孙雅雯主任和我院黄淑红教授为共同通讯作者,王丹丹副院(所)长参与了本科生工作指导。

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  食管鳞状细胞癌(ESCC)是我国常见的消化道恶性肿瘤,早期食管癌患者经治疗,5年生存率可达90%,而肿瘤一旦转移,患者生存率仅有3.1%。上皮-间质转化EMT是肿瘤转移的主要途径。但食管癌转移过程中各分期阶段的EMT特征分子并不明确。该研究通过55个全临床病理分期的ESCC单细胞转录组数据鉴定出EMT阳性细胞群体,并确定了87ESCC 特异EMT相关基因;根据这些特征分子对ESCC患者进行分型,发现高EMT的患者预后差;为改善EMT+患者预后,该研究预测了ESCC EMT靶向药物,并通过实验验证发现达克利司、多西他赛和雷贝马德林等药物可通过抑制ESCC EMT达到降低肿瘤转移的效果。

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  该项研究中盛楷雯和张琦主要进行生物信息学数据分析工作,两人202110月加入郭老师实验室,每周向指导老师汇报本周学习情况与科研进展,熟练掌握了R语言,linux操作系统,scRNA-seqscATAC-seq和转录组等高通量测序分析技术。依托该项目研究基础,她们在指导老师的帮助下组建本科生团队,获得了第九届全国大学生基础医学创新研究暨实验设计大赛国家级金奖和2023年国家级大学生创新创业训练项目。


学生感悟:

最初,怀着忐忑的心情询问郭老师可否加入他的实验室。转瞬已经过去了两年半的时光,回望实验室的点点滴滴,从最初最简单的linux账户登录,到反复查阅文献、设计方案、组会讨论,推翻了一遍又一遍,熬一个又一个凌晨,牺牲了一个又一个假期。论文发表过程有选题时的迷茫,研究时的煎熬,修改时的疲惫,等待时的焦虑,被拒时的郁闷,再到接收时的喜悦!一路走来非常感谢郭老师和整个团队的支持和协助,特别要感谢实验室同级本科生的密切合作,是他们的帮助才让我们共同成功战胜了一个又一个挑战。同时,遇到挑战时请记住:放弃不难,但坚持很酷!


全文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38342234/





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